熒光定量PCR是1996 年由美國Applied Biosystems 公司推出的一種新定量試驗技能,它是通過熒光染料或熒光標記的特異性的探針,對PCR產(chǎn)品進行標記盯梢,實時在線監(jiān)控反應過程,結合相應的軟件能夠對產(chǎn)品進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。
熒光定量PCR原理
PCR擴增時在參加一對引物的一起參加一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩頭分別標記一個陳述熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,陳述基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;剛開始時, 探針結合在DNA恣意一條單鏈上;PCR擴增時,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使陳述熒光基團和淬滅熒光基團別離,然后熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,完成了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)品形成徹底同步?;蛘哌\用熒光染料SYBR。SYBR能夠結合到雙鏈DNA上面,當系統(tǒng)中的模板被擴增時,SYBR能夠有用結合到新組成的雙鏈上面,跟著PCR的進行,結合的SYBR燃料越來越多,被儀器檢測到的熒光信號越來越強,然后到達定量的意圖。
熒光定量PCR試驗過程:
樣品RNA的抽提
①取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其徹底溶解。
②兩相別離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中參加0.2ml的氯仿,蓋緊管蓋。手動劇烈振動管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為基層的紅色酚氯仿相,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時參加的TRIZOL試劑的60%。
③RNA沉積 將水相上層轉移到一潔凈無RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉積其間的RNA,混勻后15到30℃孵育10分鐘后,于4℃下12000rpm 離心10分鐘。此時離心前不可見的RNA沉積將在管底部和側壁上形成膠狀沉積塊。
④RNA清洗 移去上清液,每1mlTRIZOL試劑裂解的樣品中參加至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O制造),清洗RNA沉積。混勻后,4℃下7000rpm離心5分鐘。
⑤RNA干燥 當心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉積在室溫空氣中干燥5-10分鐘。
⑥溶解RNA沉積 溶解RNA時,先參加無RNA酶的水40μl用槍重復吹打幾次,使其徹底溶解,獲得的RNA溶液保存于-80℃待用。
微信掃一掃
